Upas träd

The upas tree (Antiaris toxicaria Lesch.) is a medically important plant that contains various specialized metabolites with significant bioactivity. The lack of a reference genome hinders the in-depth study as well as rational exploitation and conservation of this plant. Den klassificeras av Hawthorne W. I Afrika finns det tre sorter som tydligt skiljer livsmiljö och deras juvenila former.

Även om de flesta av de sammansatta pseudokromosomerna har telomersekvensfunktioner, har vissa kortare eller saknade telomersekvenser, på grund av ofullständig montering eller otillräcklig expansion. Det används ofta som mulch eller grön gödsel i lokala trädgårdar, som dock måste odlas utanför skuggan av en extremt tät trädtak. Metoder för växtmaterial. FASTP v. Från den yttre ringen till den inre ringen är fördelningarna av pseudokromosomer, densitet i i klass I, densitet C i klass II, D, D är proteinets kodningstäthet, E är andelen tandemrepetition, innehållet i F GC och G: syntenblock.

Fröet från frukten, som är en mjuk och ätbar [15] röd eller lila drenar 2 cm i diameter, sprids av fåglar, fladdermöss, possum, apor, rådjur, antiloper och människor.I Afrika och Polynesien skördas bastfiber och används för att göra stark, grov bark för kläder. Eftersom trä är mycket enkelt och jämnt rengjort används det vanligtvis för faner. De klibbiga ändarna av de klyvda DNA-fragmenten fästes på biotin-märkta adaptrar, som var speciellt berikade för att producera fragment av ungefär AD för att bygga ett HI-C-bibliotek.

Antiaris Toxicaria är ett utmärkt, snabbt växande skuggträd som ofta odlas runt människors hem för skugga.

Full text

Såsäsongen i Kenya är Mars. Vissa resenärer berättar för oss att upas-trädet är det mest giftiga i världen, så ingen kan komma till bröstet innan de faller döda. I de olika etniska grupperna på Filippinerna, Borneo, Sulawesi och Malaysia är koncentrerad juice antiaris-giftig, bland andra namn. Koncentratet appliceras genom att doppa på pilar som används i Sumpitblåsvapen som används för jakt och krigföring.

Contig-N50-längden för varje haploid genom nådde 60 MB, och antalet luckor var mindre än 10 i båda haploida genomerna Tabell 1. Illumina-kortläsningssekvenseringen genererade cirka GB rådata på cirka miljoner 2 xnumx BP-läsningar, vilket resulterade i täckning på cirka gånger. Biblioteken sekvenserades med Illumina novaseq-plattformen, genererar ungefär 6.

Den ätbara frukten är en röd eller lila drupe 2 cm i diameter, med ett enda frö. Två typer av vävnadsstammar och löv skördades från samma enskilda växt för RNA-extraktion. Barken har en hög koncentration av tanniner, som används vid traditionell färgning av kläder och färger. Planta Medica, - Boer, E. En av dem är främst begränsad till skogsklädda ängar, de andra två är i fuktiga skogar; regnskogar, flodskogar och halvskogskogar.

RNA-seq-bibliotek förbereddes separat för varje typ av vävnad, med ett bibliotek byggt för stjälkar och ett bibliotek byggt för blad. På vissa öar öster om Nederländska Nya Guinea förberedde unga män och jungfrur en kärlekscharm från barken på ett träd-det var förmodligen giftigt, som hippomaniac manzanilla eller Antiaris Toxicaria, ett dödligt Java-träd som kunde förgifta luften runt med sin ånga och dödligt fantastisk man och djur." Litteratur Berg, C.

Bulletin Du Jardin Botanique National de Belgique, - Bisset, N. hjärtglykosider: Del VI. Moraceae: släktet Antiaris Lesch. Upas-trädet innehåller en komplex blandning av carenolider, och en serie carenolider har isolerats från dess latex 16, 17, frön 18, 19, stjälkar 20, och barken av dessa föreningar visar ett brett spektrum av biologisk aktivitet, såsom ökad hjärtkontraktilstyrka och inhibering av proliferationen av human magcancer, hepatocellulär karcinom och lungcancerceller 20, 22, på grund av bristen på ett referensgenom, den genetiska grunden för karcanolid och flavonoidberikning i upas-trädet, för att undersöka och genvägar som kodar för biosyntesen av carenolider härrörande från växter har inte dechiffrerats här, presenterar vi ett högkvalitativt referensgenom av upas-trädet Så vitt vi vet är upas-trädets genom den första holotypen som löses av genomet från Moraceae-familjen.

Totalt erhölls cirka 14 GB av cirka 47 miljoner 2 JST bp-avläsningar för genomannotation. Totalt mottogs cirka 76 GB av cirka miljoner högkvalitativa HI-C-dataavläsningar efter att adaptrarna trimmades och lågkvalitativa avläsningar filtrerades bort. Dessa sammanhängande kartlades sedan med ett ofullständigt fält följt av Hetorganelle v. Sammansättningen av genomet fixerade de ungefär sammansatta organellgenomerna, innehöll kloroplastgenomet och mitokondriellt genom med längd, BP respektive BP.

Det sammansatta kärngenomet i upas-trädet är ungefär 1. De filtrerade HI-C-uppgifterna gav täckning ungefär en gång. För att ytterligare förbättra sammansättningen anpassades HIFI-avläsningar tillbaka till dessa ofullständigt sammansatta pseudokromosomerer, och avläsningar nära telomeren monterades i sammanhängande med hjälp av HiFiasm v. Redundans v. Referensgenomet kommer att fungera som en värdefull genetisk resurs för att studera upas-trädets evolutionära biologi och funktionella genomik, samt för att studera genvägarna som är involverade i biosyntesen av carenolid härrörande från växter.

The upas tree, Antiaris toxicaria, grows throughout the world, particularly the tropical areas of Africa, Asia, and Australia

Giftet erhölls av dömda inkräktare, varav knappt två av tjugo återvände. Det sammansatta genomet på kromosomnivå har förbättrats med hjälp av manuellt styrd v-juicejuice. Kläder är ofta dekorerad med ett färgämne gjord av barken av tanniner. HiFi-uppgifterna gav täckning på cirka 51 gånger. Monteringsdimensionerna liknar den uppskattade storleken på upas-trädets haploida genom.

programmet. Genomstorlek och heterozygositetsuppskattning baserat på ren belysningssekvenseringsdata uppskattades storleken och heterozygositeten hos upas-trädgenomet med hjälp av K-mer-analys erhållen från frekvensfördelningen av ytterligare k-MERS.

The assembled nuclear genome of upas tree (approximately Gb) comprised two complete haplotypes, with a genome size of approximately Mb and Mb, respectively (Table 1)

Trädet sägs förstöra allt djurliv inom en radie av 15 miles eller mer. Det uppskattades vara ungefär MB, en ytterligare siffra. Bladskräp är ett utmärkt kompostmaterial och innehåller mycket näringsämnen. slutligen, NextPolish v. I familjen Moraceae, Antiaris Lesch. På grund av namnförvirringen har de giftiga effekterna av den dödliga dalen tillskrivits Upas-trädet.